Matlab+SPM12+CAT12三件套:VBM分析中的双样本t检验保姆级教程

vbm 分析_手把手系列教程:使用FSL进行VBM分析 本文将介绍使用FMRIB Software Library(FSL)做VBM(voxel-based morphometry)分析。操作系统:linux系统;本教程使用的环境是ubuntu-18.04.1;虽然ubuntu目前的最新版本是18.10,但最好不要安装最新版本,相关的配套插件尚未完善,FSL运行要报错。FSL版本号为FSL 6.0.0。一、准备原始数据(1)新建一个文件夹(假... 阅读详情

Matlab+SPM12+CAT12三件套:VBM分析中的双样本t检验保姆级教程

神经影像学研究中,基于体素的形态学测量(VBM)是分析脑结构差异的重要方法。对于刚接触该领域的研究者而言,如何正确配置软件环境、处理数据并解读结果往往令人望而生畏。本文将手把手带你完成从软件安装到结果可视化的完整流程,特别针对双样本t检验这一常用统计方法提供可复用的代码模板和参数配置建议。

1. 环境配置与数据准备

1.1 软件安装与路径设置

确保已安装Matlab(建议R2018a或更新版本),然后按以下顺序安装工具包:

% 添加SPM12到路径
addpath('/path/to/spm12');
spm('fmri');

% 添加CAT12到路径
addpath('/path/to/cat12');
cat12;

常见问题排查:

  • 若出现Undefined function错误,检查路径是否包含所有子目录
  • CAT12需要兼容的SPM12版本,建议使用官方推荐组合

1.2 数据组织结构

规范的文件夹结构能显著提高工作效率:

/project_root
│
├── /raw_data          # 原始DICOM文件
├── /preprocessed      # 预处理后数据
│   ├── /gm            # 灰质图像
│   ├── /wm            # 白质图像  
│   └── /csf           # 脑脊液图像
├── /stats             # 统计分析结果
└── /scripts           # 分析脚本

提示:使用spm_select函数批量获取文件路径时,规范的目录结构能简化代码编写

2. 预处理流程精要<

vbm 分析_手把手系列教程:使用ERPLAB进行单个被试的ERP分析 点击蓝字关注我们假设Matlab已经装好,笔者所用为MATLAB2018b。安装EEGLAB打开以下网址下载EEGLAB:https://sccn.ucsd.edu/eeglab/download.php将文件下载好之后随便解压到哪个文件夹。打开MATLAB,设置路径到EEGLAB的文件夹,如下图所示:保存并关闭。在MATLAB命令行窗口输入eeglab并按回车键:eeglab安装成功... 阅读详情

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