R语言机器学习算法实战系列(十三)随机森林生存分析构建预后模型 (Random Survival Forest)

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介绍

随机森林生存分析(Random Survival Forest,简称RSF)是一种用于处理右删失数据(即生存时间数据)的机器学习方法,它是传统随机森林算法在生存分析领域的扩展。RSF的目标变量是生存时间,它考虑了每个样本的生存时间(T)和删失时间(C),其中删失时间指的是在观察期间内未发生感兴趣事件的时间。RSF框架的核心步骤包括:

  1. 数据重采样:从原始数据中抽取多个bootstrap样本,每个样本平均排除一定比例的数据,称为袋外数据(Out-Of-Bag, OOB)。
  2. 构建生存树:对每个bootstrap样本构建一棵二叉生存树。在树的每个节点上,随机选取一定数量的候选变量,并使用最大化子节点之间生存差异的候选变量进行拆分。
  3. 生长限制:在叶节点不少于一定数量死亡事件的约束下,将树生长到完整大小。
  4. 累积风险函数:对每棵树计算累积风险函数(Cumulative Hazard Function, CHF),得到集成累积风险函数的均值。
  5. 预测误差计算:使用OOB数据,计算集成累积风险函数预测误差。

RSF算法的中心元素是生成生存树和构建集成CHF。RSF算法通过集成多棵生存树的预测来提高生存分析的准确性。这种方法可以处理多个协变量,包括噪声协变量,以及协变量之间复杂的非线性关系,而无需事先指定这些关系。

在实际应用中,RSF可以用于预测个体的生存时间,评估不同治疗策略的效果,或者识

VIP 临床医学 RANDOM SURVIVAL FORESTS(randomSurvivalForest)-1 我们引入了随机生存森林(Random Survival Forests),这是一种用于分析右删失生存数据的随机森林方法。本文提出了。 开通可读全文·1.3k 阅读·9 点赞·13 收藏 阅读全文

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