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基因组数据可视化与甲基化分析：从基础操作到深入洞察
1. 基因组查看器应用介绍
基因组查看器应用程序允许用户通过嵌入式的综合基因组查看器（IGV）来查看和探索整合的基因组数据，这些数据包括下一代测序（NGS）读取比对、基因组变异和分段拷贝数数据。
1.1 打开应用程序
有两种方式可以打开该应用程序：
- 在命令行中输入 genomicsViewer 。
- 点击应用程序标签页上的应用程序图标。
该应用程序需要互联网连接，默认情况下，它会加载人类（GRCh38/hg38）作为参考序列，并使用 Refseq 基因作为注释文件。应用程序有两个主要面板，左边是轨道面板，右边是嵌入式 IGV 网络应用程序。轨道面板是一个只读区域，显示轨道名称、源文件名和轨道类型，当你在嵌入式 IGV 应用程序中配置轨道时，轨道面板会相应更新。重置按钮可以将应用程序恢复到默认视图，包含两个轨道（HG38 和 Refseq 基因），并移除其他现有轨道。在重置之前，你可以将当前视图保存为会话（.json）文件，以便稍后恢复。
1.2 导入数据添加轨道
1.2.1 导入参考序列
你可以导入单个参考序列，该序列必须是 FASTA 文件。在主页标签页上选择“导入参考”，你还可以导入包含细胞遗传学 G 带数据的相应细胞带文件。可以添加本地文件或指定外部 URL，但 URL 必须以 https 或 gs 开头，其他文件传输协议（如 ftp ）不支持。
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