R数据分析:跟随top期刊手把手教你做一个临床预测模型

本文介绍临床预测模型评估指标,如灵敏度、特异度等,并使用R语言进行实操演示,包括ROC曲线绘制及AUC计算。

临床预测模型也是大家比较感兴趣的,今天就带着大家看一篇临床预测模型的文章,并且用一个例子给大家过一遍做法。

这篇文章来自护理领域顶级期刊的文章,文章名在下面

Ballesta-Castillejos A, Gómez-Salgado J, Rodríguez-Almagro J, Hernández-Martínez A. Development and validation of a predictive model of exclusive breastfeeding at hospital discharge: Retrospective cohort study. Int J Nurs Stud. 2021 May;117:103898. doi: 10.1016/j.ijnurstu.2021.103898. Epub 2021 Feb 7. PMID: 33636452.

文章作者做了个出院时单纯母乳喂养的预测模型,数据来自两个队列,一个队列做模型,另外一个用来验证。样本量的计算用的是“10个样本一个变量”的标准,预测结局变量是个二分类,变量筛选的方法依然是单因素有意义的都纳入预测模型中,具体的建模方法是logistic回归模型。然后用AUC进行模型的评估。

在结果报告上,作者报告了所有的有意义的预测因素,每个因素会展示OR和OR的置信区间,还有整体模型的评价指标,包括展示了模型的ROC曲线,和AUC,作者还展示了不同概率阶截断值下的模型的Sensitivity, Specificity, PPV, NPV, LR+, LR-。如图:

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