SimpleITK图像基础(一)——3D Resampling

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文章目录前言基于SimpleITK进行实现前言进入深度学习网络之前需要进行统一数据集,这个时候需要对这些数据集进行重新采样,即假设各向同性体素并重新定向它们,以便可以读取所有图像的像素矩阵。在将方位变换成一致时,可以用DICOMOrientImageFilter过滤器,可以将 DesiredCoordinateOrientation设置为你想要变换的方位,它将计算出所需的置换顺序并根据需要执行翻转以接近所需方向。基于SimpleITK进行实现workflow如下:step 1:首先运行DICOM
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前言

进入深度学习网络之前需要进行统一数据集,这个时候需要对这些数据集进行重新采样,即假设各向同性体素并重新定向它们,以便可以读取所有图像的像素矩阵。
在将方位变换成一致时,可以用DICOMOrientImageFilter过滤器,可以将 DesiredCoordinateOrientation设置为你想要变换的方位,它将计算出所需的置换顺序并根据需要执行翻转以接近所需方向。

基于SimpleITK进行实现

workflow如下:
step 1:首先运行DICOMOrientImageFilter过滤器

orientation_filter = sitk.DICOMOrientImageFilter()
orientation_filter.SetDesiredCoordinateOrientation("LPS")
reoriented = orientation_filter
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