从 MongoDB 及 Mysql 谈B-/B+树

为什么 MongoDB 索引选择B树,而 Mysql 选择B+树 前言 之前有人看了我的博客提出了这个问题,我懒省事让他自行百度,今天发现网上的答案很多,但是很啰嗦或者让人看不懂,所以就写下了这篇文章 一、B树和B+树的区别 很明显,我们要想弄清楚原因就要知道B树和B+树的区别。为了不长篇大论。我们直接给出他们的形式总结他们的特点。 1、B树 B树是一种自平衡的搜索树,形式很简单: 这就是一颗B树。针对我们这个问题的最核心的特点如下: (1)多路,非二叉树 (... 阅读详情

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前两天有位朋友邀请我回答个问题,为什么 MongoDB (索引)使用B-树而 MySQL 使用 B+树?我觉得这个问题非常好,从实际应用的角度来学习数据结构,没有比这更好的方法了。因为像 Mysql 和 MongoDB 这种经久考验的大型软件在设计上都是精益求精的,它们为什么选择这些数据结构?:)

本文从实际应用的角度来介绍以及分析B-树和B+树。


B-树由来

定义:B-树是一类树,包括B-树、B+树、B*树等,是一棵自平衡的搜索树,它类似普通的平衡二叉树,不同的一点是B-树允许每个节点有更多的子节点。B-树是专门为外部存储器设计的,如磁盘,它对于读取和写入大块数据有良好的性能,所以一般被用在文件系统及数据库中。

定义只需要知道B-树允许每个节点有更多的子节点即可。子节点数量一般在上千,具体数量依赖外部存储器的特性。

先来看看为什么会出现B-树这类数据结构。

传统用来搜索的平衡二叉树有很多,如 AVL 树,红黑树等。这些树在一般情况下查询性能非常好,但当数据非常大的时候它们就无能为力了。原因当数据量非常大时,内存不够用,大部分数据只能存放在磁盘上,只有需要的数据才加载到内存中。一般而言内存访问的时间约为 50 ns,而磁盘在 10 ms 左右。速度相差了近 5 个数量级,磁盘读取时间远远超过了数据在内存中比较的时间。这说明程序大部分时间会阻塞在磁盘 IO 上。那么我们如何提高程序性能?减少磁盘 IO 次数,像 AVL 树,红黑树这类平衡二叉树从设计上无法“迎合”磁盘。 
关于磁盘可参考 浅谈计算机中的存储模型(四)磁盘

平衡二叉树

上图是一颗简单的平衡二叉树,平衡二叉树是通过旋转来保持平衡的,而旋转是对整棵树的操作,若部分加载到内存中则无法完成旋转操作。其次平衡二叉树的高度相对较大为 log n(底数为2),这样逻辑上很近的节点实际可能非常远,无法很好的利用磁盘预读(局部性原理),所以这类平衡二叉树在数据库和文件系统上的选择就被 pass 了。

空间局部性原理:如果一个存储器的某个位置被访问,那么将它附近的位置也会被访问。

我们从“迎合”磁盘的角度来看看B-树的设计。

索引的效率依赖与磁盘 IO 的次数,快速索引需要有效的减少磁盘 IO 次数,如何快速索引呢?索引的原理其实是不断的缩小查找范围,就如我们平时用字典查单词一样,先找首字母缩小范围,再第二个字母等等。平衡二叉树是每次将范围分割为两个区间。为了更快,B-树每次将范围分割为多个区间,区间越多,定位数据越快越精确。那么如果节点为区间范围,每个节点就较大了。所以新建节点时,直接申请页大小的空间(磁盘是按 block 分的,一般为 512 Byte。磁盘 IO 一次读取若干个 block,我们称为一页,具体大小和操作系统有关,一般为 4 k,8 k或 16 k),计算机内存分配是按页对齐的,这样就实现了一个节点只需要一次 IO。

B-树

上图是一棵简化的B-树,多叉的好处非常明显,有效的降低了B-树的高度,为底数很大的 log n,底数大小与节点的子节点数目有关,一般一棵B-树的高度在 3 层左右。层数低,每个节点区确定的范围更精确,范围缩小的速度越快。上面说了一个节点需要进行一次 IO,那么总 IO 的次数就缩减为了 log n 次。B-树的每个节点是 n 个有序的序列(a1,a2,a3…an),并将该节点的子节点分割成 n+1 个区间来进行索引(X1< a1, a2 < X2 < a3, … , an+1 < Xn < anXn+1 > an)。


B-树

B-树

上图是一颗B-树,B-树的每个节点有 d~2d 个 key,2 这个因子指明了树的分裂及合并的规则,这个规则维持了B-树的平衡。

B-树的插入和删除就不具体介绍了,很多资料都描述了这一过程。在普通平衡二叉树中,插入删除后若不满足平衡条件则进行 旋转 操作,而在B-树中,插入删除后不满足条件则进行分裂及合并操作。

简单叙述下分裂及合并操作。

分裂:如果有一个节点有 2d 个 key,增加一个后为 2d+1 个 key,不符合上述规则 B-树的每个节点有 d~2d 个 key,大于 2d,则将该节点进行分裂,分裂为两个 d 个 key 的节点并将中值 key 归还给父节点。 
合并:如果有一个节点有 d 个 key,删除一个后为 d-1 个 key,不符合上述规则 B-树的每个节点有 d~2d 个 key,小于 d,则将该节点进行合并,合并后若满足条件则合并完成,不满足则均分为两个节点。

B-树的查找

我们来看看B-树的查找,假设每个节点有 n 个 key值,被分割为 n+1 个区间,注意,每个 key 值紧跟着 data 域,这说明B-树的 key 和 data 是聚合在一起的。一般而言,根节点都在内存中,B-树以每个节点为一次磁盘 IO,比如上图中,若搜索 key 为 25 节点的 data,首先在根节点进行二分查找(因为 keys 有序,二分最快),判断 key 25 小于 key 50,所以定位到最左侧的节点,此时进行一次磁盘 IO,将该节点从磁盘读入内存,接着继续进行上述过程,直到找到该 key 为止。

查找伪代码

Data* BTreeSearch(Root *node, Key key)
{
    Data* data;

    if(root == NULL)
        return NULL;
    data = BinarySearch(node);
    if(data->key == key)
    {
        return data;
    }else{
        node = ReadDisk(data->next);
        BTreeSearch(node, key);
    }
}
 
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B+树

B+树是B-树的变种,它与B-树的不同之处在于:

  • 在B+树中,key 的副本存储在内部节点,真正的 key 和 data 存储在叶子节点上 。
  • n 个 key 值的节点指针域为 n 而不是 n+1。

如下图为一颗B+树:

B+树

因为内节点并不存储 data,所以一般B+树的叶节点和内节点大小不同,而B-树的每个节点大小一般是相同的,为一页。

为了增加 区间访问性,一般会对B+树做一些优化。 
如下图带顺序访问的B+树。

带顺序访问的B+树


B-树和B+树的区别

1.B+树内节点不存储数据,所有 data 存储在叶节点导致查询时间复杂度固定为 log n。而B-树查询时间复杂度不固定,与 key 在树中的位置有关,最好为O(1)。

如下所示B-树/B+树查询节点 key 为 50 的 data。

B-树

B-树

从上图可以看出,key 为 50 的节点就在第一层,B-树只需要一次磁盘 IO 即可完成查找。所以说B-树的查询最好时间复杂度是 O(1)。


B+树

B+树

由于B+树所有的 data 域都在根节点,所以查询 key 为 50的节点必须从根节点索引到叶节点,时间复杂度固定为 O(log n)。


2.B+树叶节点两两相连可大大增加区间访问性,可使用在范围查询等,而B-树每个节点 key 和 data 在一起,则无法区间查找。

B+树

根据空间局部性原理:如果一个存储器的某个位置被访问,那么将它附近的位置也会被访问。

B+树可以很好的利用局部性原理,若我们访问节点 key为 50,则 key 为 55、60、62 的节点将来也可能被访问,我们可以利用磁盘预读原理提前将这些数据读入内存,减少了磁盘 IO 的次数。 
当然B+树也能够很好的完成范围查询。比如查询 key 值在 50-70 之间的节点。


3.B+树更适合外部存储。由于内节点无 data 域,每个节点能索引的范围更大更精确

这个很好理解,由于B-树节点内部每个 key 都带着 data 域,而B+树节点只存储 key 的副本,真实的 key 和 data 域都在叶子节点存储。前面说过磁盘是分 block 的,一次磁盘 IO 会读取若干个 block,具体和操作系统有关,那么由于磁盘 IO 数据大小是固定的,在一次 IO 中,单个元素越小,量就越大。这就意味着B+树单次磁盘 IO 的信息量大于B-树,从这点来看B+树相对B-树磁盘 IO 次数少。

B/B+树

从上图可以看出相同大小的区域,B-树仅有 2 个 key,而B+树有 3 个 key。


为什么 MongoDB 索引选择B-树,而 Mysql 索引选择B+树

这些内容了解后,我们来看为什么 MongoDB 索引选择B-树,而 Mysql (InooDB 引擎)索引选择B+树。

Mysql 大家应该比较熟悉,传统的关系型数据库,下面介绍下 MongoDB。

来看下 wiki 百科上 MongoDB 的定义:

MongoDB (from humongous) is a cross-platform document-oriented database. Classified as a NoSQL database, MongoDB eschews the traditional table-based relational database structure in favor of JSON-like documents with dynamic schemas (MongoDB calls the format BSON)

这段话的大致意思是 MongoDB 是文档型的数据库,是一种 nosql,它使用类 Json 格式保存数据。

文档型数据库和我们常见的关系型数据库不同,一般使用 XML 或 Json 格式来保存数据,归属于聚合型数据库。

键值数据库也属于聚合型数据库,熟悉 Redis 的同学应该很好理解。

举个例子:

加入我们要建立一个电子商务网站,类似淘宝这种将商品销售给用户,那么必须存储用户信息、商品目录、订单、收货地址、账单地址、付款方式等。

看下传统的关系型数据库是如何存储的:

关系型数据库

聚合型数据库存储模型:

聚合型数据库

用类似 Json 的格式表示如下:

//Customer
{
        "id":1,
        "name":Tom,
        "billingAddress":[{"city":"China"}]
}

//Orders
{
        "id":99,
        "orderItem":[
                "productId"27,
                "price":100,
                "productName":book
         ],
         "shippingAddress":[{"city":"china"}],
         "orderPayment":[
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        ]   
}
 
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相对于 Mysql 关系型数据库,MongoDB 这类 nosql 适用于数据模型简单,性能要求高的场合


为什么 MongoDB 使用B-树

MongoDB 是一种 nosql,也存储在磁盘上,被设计用在 数据模型简单,性能要求高的场合。性能要求高,看看B/B+树的区别第一点:

B+树内节点不存储数据,所有 data 存储在叶节点导致查询时间复杂度固定为 log n。而B-树查询时间复杂度不固定,与 key 在树中的位置有关,最好为O(1)

我们说过,尽可能少的磁盘 IO 是提高性能的有效手段。MongoDB 是聚合型数据库,而 B-树恰好 key 和 data 域聚合在一起。


为什么 Mysql 使用B+树

Mysql 是一种关系型数据库,区间访问是常见的一种情况,而 B-树并不支持区间访问(可参见上图),而B+树由于数据全部存储在叶子节点,并且通过指针串在一起,这样就很容易的进行区间遍历甚至全部遍历。见B/B+树的区别第二点:

B+树叶节点两两相连可大大增加区间访问性,可使用在范围查询等,而B-树每个节点 key 和 data 在一起,则无法区间查找。

其次B+树的查询效率更加稳定,数据全部存储在叶子节点,查询时间复杂度固定为 O(log n)。

最后第三点:

B+树更适合外部存储。由于内节点无 data 域,每个节点能索引的范围更大更精确

B-树和 B+树的区别 特性B-树B+树数据存储数据存储在内部节点和叶子节点数据只存储在叶子节点叶子节点链接不链接叶子节点按链表顺序链接查询效率查询时可能需要遍历多个节点查询效率较高,叶子节点按顺序存储范围查询不如B+树高效高效,通过叶子节点链表实现插入与删除操作较为复杂,可能涉及多个节点插入和删除操作较简单,只影响叶子节点内存使用节点存储数据,内存占用较大内部节点不存储数据,内存利用率更高。 阅读详情

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