2020.02.18【数据分析心得】丨如何将基因ID转化为基因名称

2021.05.05更新:将基因名称转化为基因ID

上一次在这个平台上写文章居然已经是5年前了,毕竟研究生阶段没有主攻数据处理,让自己少了很多IT属性。废话少说,今天记录一下将基因ID转化为基因名称的操作办法。

在拿到公司的基因测序数据后,不同的测序公司给出的数据也是不同的,有时候会遇到一个问题就是测序公司给出的分析报告中,GO富集以及KEGG通路通常直接以基因ID的形式给客户,而导师要求送审文章的附件要显示为基因名称。

尽管在拿到的测序数据中有所有原始数据的基因ID以及对应的基因名称的list,但一一对应转换显然不太现实。因此,读研期间,我用Excel制作了一个转换工作台来完成这项工作,没想到毕业之后,师弟师妹仍然有这个需求。于是我打算写这个文章,将这个简单的处理文档分享给大家。

转换总共包括基因格式处理、匹配基因ID与基因name、生成基因name、清洗空白域、添加分隔符、粘贴文本格式、合并基因以及粘贴文本格式并清洗分隔符8个步骤,在excel文档中每个sheet都为1个步骤。看起来似乎有些麻烦,但每一个步骤涉及的操作只有1步,可以说讲转化步骤完全拆解了。

step1.分列处理

第一步首先将待转化的基因ID列

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