GEO的表达矩阵的探针ID转换成基因名称教程

GEO探针转换为symbol

用首先下载GEO数据 有的下载会有几个对象 有的就只有一个 但是不影响 因为GSE就是数据的集合，这几个不同的对象只是测序平台不同而已 这里选择第二个对象 gset = getGEO('GSE12417', destdir=".",getGPL = F) e2=gset[[2]] #取下载geo数据list中的第一个对象 可以看见它测序用哪一个GPL平台 #也可以取其他的对象，反正记住对应的测序GPL平台 expr=e2@assayData[["exprs"]] #

GEO生信数据挖掘（三）芯片探针ID与基因名映射处理

检索到目标数据集后，开始数据挖掘，本文以阿尔兹海默症数据集GSE1297为例上节我们发现，存在一个芯片探针ID匹配到多个基因的情况，本节来介绍处理方案。

GEO生信数据挖掘（四）数据清洗（离群值处理、低表达基因、归一化、log2处理）

检索到目标数据集后，开始数据挖掘，本文以阿尔兹海默症数据集GSE1297为例，数据清洗（离群值处理、低表达基因、归一化、log2处理）

GEO生信数据挖掘（二）下载基因芯片平台文件及注释

检索到目标数据集后，开始数据挖掘，本文以阿尔兹海默症数据集GSE1297为例上节我们，但是矩阵行名称是芯片探针需要转换为基因名。

芯片数据分析步骤6 探针注释

注释探针 注释探针的原因 为了防止非特异性结合造成的干扰，芯片厂商往往会使用多个探针检测同一个基因的表达。因此，芯片厂商不会使用基因名作为探针的名称，而是使用自己定义的探针名称。要合并重复探针，我们必须先对探针进行注释，确定每个探针对应检测哪个基因的表达，然后再合并重复探针。而后续分析如GSEA，只能对基因进行分析，因此也要求对探针进行注释。 注释探针的方法 1 使用芯片厂商的...

GEO生信数据挖掘实战：基因芯片注释与探针ID转换全攻略

本文详细解析GEO生信数据挖掘中基因芯片注释与探针ID转换的完整流程，涵盖平台文件获取、表达矩阵处理及Bioconductor注释包使用等关键步骤。针对常见问题如注释缺失、数据不匹配等提供实用解决方案，帮助科研人员高效完成基因芯片数据分析，特别适合生物信息学初学者和需要处理GEO数据库的研究者。

GEO基因芯片数据实战：从数据预处理到Limma差异表达分析全流程解析

本文详细解析了GEO基因芯片数据从下载、预处理到使用Limma包进行差异表达分析的全流程。重点介绍了数据清洗、对数转换、设计矩阵构建、经验贝叶斯统计模型应用，以及结果筛选与可视化方法，帮助生物信息学研究者高效挖掘公共数据中的生物学意义。

seurat提取表达矩阵_GPL17586、GPL19251和GPL16686平台芯片ID转换

芯片分析中经常会遇到Affymetrix Human Transcriptome Array 2.0芯片,由于目前还没有现成的R包可以用，因此分析方法也不统一。见生信技能树Jimmy老师HTA2.0芯片比较麻烦，其实这类常见的有3个平台，3种类型：GPL17586 [HTA-2_0] Affymetrix Human Transcriptome Array 2.0 [transcript (gen...

9篇4章7节：GEO 数据库之炎症性肠病基因表达分析演示（三）

在基因表达分析中，芯片探针ID通常需要转换为 Gene Symbol，以便与生物学实体直接对应。然而，一个 Gene Symbol 可能对应多条探针，这会导致表达矩阵中行名重复，从而影响差异表达分析和下游功能分析的准确性。本文介绍了如何使用 biomaRt 或芯片注释包获取探针与 Gene Symbol 的对应关系，统计重复探针分布，并将表达矩阵转换为数据框，合并注释信息，最终通过去重方法生成唯一行名的基因表达矩阵，为后续分析提供标准化的数据基础。

NotImplementedError: Cannot copy out of meta tensor； no data! Please use torch.nn.Module.to_empty()

Please use torch.nn.Module.to_empty() instead of torch.nn.Module.to()输出(llama) (base) [root@localhost home]# nvidia-smi Unable to determine the device handle for GPU0000:09:00.0: Unknown Error。这是典型的“孤儿进程”，但它还是。(僵尸进程)，占用 GPU 资源。如果进程仍然不消失，并且。，这意味着它的父进程是。

Proteus快速入门（最详细教程）

Proteus 是一款用于嵌入式单片机仿真的软件，用于在打PCB板之前对软件程序和硬件电路的正确性进行仿真验证。1.所以Proteus一般会和Keil软件进行联合仿真，在Proteus中绘制系统的电路图，在Keil软件中编写对应的程序后生成Hex文件。2.Proteus的仿真结果仅供参考，只能在一定程度上验证系统的可能性。实际实物系统还需要进行进一步的调试。以上即为本次分享的Proteus入门教程的全部内容，希望可以能够帮助到各位道友。

2023 年全国网络安全行业职业技能大赛-电子数据取证分析师-决赛WP_2023网络安全行业赛取证

数据库取证工具里面可以恢复删除掉的数据带红叉的就说删除过的，game库下面announcement_detail表里面update_time字段使用sql语句时间戳最大为1513243355转换时间为2017-12-14 17:22:35。

《阵列信号处理及MATLAB实现》阵列响应矩阵(均匀线阵、均匀圆阵、L型阵列、平面阵列和任意阵列)

《阵列信号处理及MATLAB实现》内容总结，如需阅读更详细内容请购买正版书籍。

Ubuntu 20.04 上 Geant4 安装避坑全记录：从源码编译到 B1 示例跑通（含数据包加速下载）

本文详细记录了在Ubuntu 20.04系统上从源码编译安装Geant4的全过程，包括环境准备、依赖安装、CMake参数解析、多线程编译优化以及数据包加速下载等关键步骤。特别针对B1示例的测试与验证提供了完整流程，帮助科研人员和学生避开常见安装陷阱，提升粒子物理模拟效率。

8、Windows 部署ollama

一个本地运行大模型的集成框架，目前主要针对主流的LLaMA架构的开源大模型设计，通过将模型权重、配置文件和必要数据封装进由Modelfile定义的包中，从而实现大模型的下载、启动和本地运行的自动化部署及推理流程。此外，Ollama内置了一系列针对大模型运行和推理的优化策略，目前作为一个非常热门的大模型托管平台，已被包括LangChain、Taskweaver等在内的多个热门项目高度集成。

【C++】【STL算法】数据窄化及代码安全性

本文系统探讨了C++工程中数据窄化(narrowing conversion)的隐患与解决方案。数据窄化指将高精度/大范围类型转换为低精度/小范围类型，虽语法合法但会导致静默精度损失。其危险性体现在：错误隐蔽、STL会放大问题、数值错误具有传播性。现代C++要求窄化必须显式声明，文中提出四种工程解决方案：显式转换、边界统一转换、范围检查转换和使用GSL工具。建议在系统边界集中处理窄化，保持计算链路类型一致性，并通过分层策略(建模用double，控制用float)确保数值稳定性。核心思想是让窄化成为清晰可控的

Codex 100个真实案例 - 用AI绘制CAD机械图纸（工程师看了直呼内行）

本案例将展示如何用 Codex 生成 Python 脚本，通过 `ezdxf` 库绘制标准 DXF 格式的 CAD 机械图纸。我们会从零开始，逐步实现直线、圆、圆弧、标注等基本图形元素，最终绘制出一张包含主视图、俯视图、尺寸标注、标题栏和技术要求的完整法兰盘零件图。还会演示参数化批量生成不同规格零件图和自动 BOM 物料清单，生成的 DXF 文件可直接在 AutoCAD、FreeCAD 中打开。全程用自然语言驱动 Codex，工程师看完直接上手！

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温度PID稳定控制程序，适用于欧姆龙PLC，对其他PLC也具有很大参考价值

STM32F407中文手册

STM32f407中文手册 本参考手册面向应用开发人员，提供有关使用 STM32F405xx/07xx、STM32F415xx/17xx、 STM32F42xxx 和 STM32F43xxx 微控制器存储器与外设的完整信息。STM32F405xx/07xx、STM32F415xx/17xx、STM32F42xxx 和 STM32F43xxx 构成一个微 控制器系列，各产品具有不同的存储器大小、封装和外设。有关订购信息以及器件的机械与电气特性，请参见数据手册。有关 ARM Cortex™-M4F 内核的信息，请参见《Cortex™-M4F 技术参考手册》。

蓝牙模块HM-10手册

蓝牙模块HM-10手册，该手册对蓝牙模块HM-10进行了详细的介绍和使用方法以及一些AT指令。