ARID3B

ARID3B
Ідентифікатори
Символи	ARID3B, BDP, DRIL2, AT-rich interaction domain 3B
Зовнішні ІД	OMIM: 612457 MGI: 1930768 HomoloGene: 4721 GeneCards: ARID3B
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • зв'язування з ДНК • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • транскрипція РНК-полімеразою II • ДНК-матрична транскрипція • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10620	56380
Ensembl	ENSG00000179361	ENSMUSG00000004661
UniProt	Q8IVW6	Q9Z1N7
RefSeq (мРНК)	NM_001307939 NM_006465	NM_019689 NM_001379353
RefSeq (білок)	NP_001294868 NP_006456	NP_062663 NP_001366282
Локус (UCSC)	Хр. 15: 74.54 – 74.6 Mb	Хр. 9: 57.7 – 57.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ARID3B (англ. AT-rich interaction domain 3B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 561 амінокислот, а молекулярна маса — 60 637.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEPLQQQQQQ		QQQQQKQPHL		APLQMDAREK		QGQQMREAQF		LYAQKLVTQP
TLLSATAGRP		SGSTPLGPLA		RVPPTAAVAQ		VFERGNMNSE		PEEEDGGLED
EDGDDEVAEV		AEKETQAASK		YFHVQKVARQ		DPRVAPMSNL		LPAPGLPPHG
QQAKEDHTKD		ASKASPSVST		AGQPNWNLDE		QLKQNGGLAW		SDDADGGRGR
EISRDFAKLY		ELDGDPERKE		FLDDLFVFMQ		KRGTPINRIP		IMAKQILDLY
MLYKLVTEKG		GLVEIINKKI		WREITKGLNL		PTSITSAAFT		LRTQYMKYLY
AYECEKKALS		SPAELQAAID		GNRREGRRPS		YSSSLFGYSP		AAATAAAAAG
APALLSPPKI		RFPILGLGSS		SGTNTSSPRI		SPATTLRKGD		GAPVTTVPVP
NRLAVPVTLA		SQQAGTRTAA		LEQLRERLES		GEPAEKKASR		LSEEEQRLVQ
QAFQRNFFSM		ARQLPMKIRI		NGRAEDRAEA		SAAALNLTTS		SIGSINMSVD
IDGTTYAGVL		FAQKPVVHLI		TGSAPQSLGS		SASSSSSSHC		SPSPTSSRGT
PSAEPSTSWS		L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Kobayashi K., Era T., Takebe A., Jakt L.M., Nishikawa S. (2006). ARID3B induces malignant transformation of mouse embryonic fibroblasts and is strongly associated with malignant neuroblastoma. Cancer Res. 66: 8331—8336. PMID 16951138 doi:10.1158/0008-5472.CAN-06-0756
• Kim D., Probst L., Das C., Tucker P.W. (2007). REKLES is an ARID3-restricted multifunctional domain. J. Biol. Chem. 282: 15768—15777. PMID 17400556 doi:10.1074/jbc.M700397200
• Numata S., Claudio P.P., Dean C., Giordano A., Croce C.M. (1999). Bdp, a new member of a family of DNA-binding proteins, associates with the retinoblastoma gene product. Cancer Res. 59: 3741—3747. PMID 10446990

Див. також

• Хромосома 15