NFIX

NFIX
Ідентифікатори
Символи	NFIX, MRSHSS, NF1A, SOTOS2, nuclear factor I X, NF1-X, NF-I/X, CTF, MALNS
Зовнішні ІД	OMIM: 164005 MGI: 97311 HomoloGene: 1872 GeneCards: NFIX
Пов'язані генетичні захворювання
Marshall–Smith syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • зв'язування з ДНК • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • клітинне ядро Біологічний процес • реплікація ДНК • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • транскрипція РНК-полімеразою II • ДНК-матрична транскрипція • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4784	18032
Ensembl	ENSG00000008441	ENSMUSG00000001911
UniProt	Q14938	P70257
RefSeq (мРНК)	NM_001271043 NM_001271044 NM_002501 NM_001365902 NM_001365982 NM_001365983 NM_001365984 NM_001365985 NM_001378404 NM_001378405	NM_001081981 NM_001081982 NM_001297601 NM_010906
RefSeq (білок)	NP_001257972 NP_001257973 NP_002492 NP_001352831 NP_001352911 NP_001352912 NP_001352913 NP_001352914 NP_001365333 NP_001365334	NP_001075450 NP_001075451 NP_001284530 NP_035036 NP_001357981 NP_001357982 NP_001357983 NP_001357984 NP_001357985 NP_001357986 NP_001357987 NP_001357988 NP_001357989 NP_001357990 NP_001357991 NP_001357992
Локус (UCSC)	Хр. 19: 13 – 13.1 Mb	Хр. 8: 84.7 – 84.8 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NFIX (англ. Nuclear factor I X) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 502 амінокислот, а молекулярна маса — 55 098.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYSPYCLTQD		EFHPFIEALL		PHVRAFSYTW		FNLQARKRKY		FKKHEKRMSK
DEERAVKDEL		LGEKPEIKQK		WASRLLAKLR		KDIRPEFRED		FVLTITGKKP
PCCVLSNPDQ		KGKIRRIDCL		RQADKVWRLD		LVMVILFKGI		PLESTDGERL
YKSPQCSNPG		LCVQPHHIGV		TIKELDLYLA		YFVHTPESGQ		SDSSNQQGDA
DIKPLPNGHL		SFQDCFVTSG		VWNVTELVRV		SQTPVATASG		PNFSLADLES
PSYYNINQVT		LGRRSITSPP		STSTTKRPKS		IDDSEMESPV		DDVFYPGTGR
SPAAGSSQSS		GWPNDVDAGP		ASLKKSGKLD		FCSALSSQGS		SPRMAFTHHP
LPVLAGVRPG		SPRATASALH		FPSTSIIQQS		SPYFTHPTIR		YHHHHGQDSL
KEFVQFVCSD		GSGQATGQPN		GSGQGKVPGS		FLLPPPPPVA		RPVPLPMPDS
KSTSTAPDGA		ALTPPSPSFA		TTGASSANRF		VSIGPRDGNF		LNIPQQSQSW
FL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, реплікація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Apt D., Liu Y., Bernard H.U. (1994). Cloning and functional analysis of spliced isoforms of human nuclear factor I-X: interference with transcriptional activation by NFI/CTF in a cell-type specific manner. Nucleic Acids Res. 22: 3825—3833. PMID 7937100 doi:10.1093/nar/22.19.3825
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Qian F., Kruse U., Lichter P., Sippel A.E. (1995). Chromosomal localization of the four genes (NFIA, B, C, and X) for the human transcription factor nuclear factor I by FISH. Genomics. 28: 66—73. PMID 7590749 doi:10.1006/geno.1995.1107

Див. також

• Хромосома 19